目前，近红外荧光导航技术主要应用吲哚菁绿（ICG）作为显影剂，少量报道应用叶酸受体及发光基团合成荧光剂作为显影剂。ICG是已通过美国FDA及中国食品药品监督管理总局（CFDA）批准的临床诊断用药，可以作为近红外荧光显影剂。该药已经在眼底造影、前哨淋巴结活检、肝癌肿瘤切除等多个方面进行应用。

基于血供的应用  

（1）肺段边界的确定：肺段边界的确定主要靠夹闭靶段支气管后通气-膨胀法确定。但此种方法容易造成胸腔镜下视野不好，拖慢手术进程。Kasai等人于2013年报道了一种应用ICG进行术中精确肺段显影的新方法。此种方法简便易行，肺段边界显示清晰，同时对手术进程无明显影响。

（2）管胃血供情况的判断：吻合口瘘是食管癌根治术后严重并发症之一。近些年研究表明，管胃血供是吻合口瘘的重要发生因素之一。近红外荧光技术可以协助判断食管癌管状胃血供，并有可能减少吻合口瘘的发生率，但仍需前瞻性随机对照试验的进一步验证。

基于淋巴循环的应用

乳糜胸是食管及肺手术术后并不少见的一种并发症，可能引发严重并发症。引流量较多者需行二次手术修补胸导管。Matsutani等于2014年报道了ICG近红外荧光引导下经腹判断乳糜漏部位并结扎胸导管的病例。该技术同样被应用于先心病术后乳糜漏的定位与修复。这些病例报道表明，通过ICG近红外荧光引导下进行胸导管破损显影是可行的，但仍需大宗病例报道来证明其可行性及有效性。

基于增强的通过及潴留性（EPR）效应的应用   

随着CT分辨率的提高，肺内小结节的检出率也逐渐提高。但术前CT分辨率往往有限，对于直径小于0.5 cm的微小结节可能出现漏诊，尤其是胸膜下结节的检出率更低。可见光下肺手术，微小结节可能有很高的漏诊率，而近红外荧光技术则可降低漏诊率。